首页 / 院系成果 / 成果详情页

基于多源公开数据库整合分析核心基因构建肺腺癌预后风险模型  期刊论文  

  • 编号:
    3A5E9CCA8BE643904CECE83188B87AE3
  • 作者:
  • 地址:
    天津医科大学肿瘤医院肺部肿瘤科,国家恶性肿瘤临床医学研究中心,天津市恶性肿瘤临床医学研究中心,天津市肿瘤防治重点实验室,天津市肺癌诊治中心;天津医科大学肿瘤医院肿瘤细胞生物学实验室;天津市儿童医院(天津大学儿童医院),天津市儿童出生缺陷防治重点实验室;
  • 语种:
    中文
  • 期刊:
    中国肺癌杂志 ISSN:1009-3419 2025 年 28 卷 10 期 (751 - 760) ; 2025年10月
  • 收录:
  • 关键词:
  • 摘要:

    背景与目的 肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)靶向治疗中酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitors, TKIs)耐药问题突出,亟需筛选与耐药及预后相关的关键分子标志物以指导精准治疗。本研究旨在探究LUAD TKIs耐药的分子机制,筛选核心差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),明确不同基因聚类与患者生存、药物反应的关联,构建并验证LUAD预后预测的风险模型,为LUAD精准治疗与预后评估提供依据。方法整合GSE162045、GSE114647等多个LUAD相关数据集,通过韦恩图筛选核心重叠DEGs并构建基因相关性网络。采用共识聚类法对样本进行分组,结合t-SNE降维可视化验证聚类稳定性与区分度。运用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)与基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)探究DEGs功能。比较不同聚类中12种药物的半抑制浓度(50%maximal inhibitory concentration, IC50)值,评估药物敏感性差异。通过LASSO回归筛选预后相关核心基因构建风险模型,并在GSE31210队列中通过桑基图、Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征(reciever operating characteristic, ROC)曲线验证模型效能。分析关键基因在不同聚类及风险组间的表达差异,绘制单基因表达与生存关联的Kaplan-Meier曲线。基于多个数据集(GSE19804、GSE19188、GSE44077、GSE30219)分析PLEK2在LUAD组织中的表达,并通过Western blot检测其在表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)-TKIs耐药细胞系中的蛋白水平。结果 筛选出12个核心DEGs(如HMGA1、PLEK2等);当聚类数(K值)为2时样本稳定分为Cluster A和Cluster B,10个核心基因在两组中表达差异显著(P<0.0001),且Cluster A患者总生存期(overall survival, OS)、无病生存期(disease-free survi...

  • 推荐引用方式
    GB/T 7714:
    王成蒙,张露,张钰, 等. 基于多源公开数据库整合分析核心基因构建肺腺癌预后风险模型 [J].中国肺癌杂志,2025,28(10):751-760.
  • APA:
    王成蒙,张露,张钰,王宇,&王勐.(2025).基于多源公开数据库整合分析核心基因构建肺腺癌预后风险模型 .中国肺癌杂志,28(10):751-760.
  • MLA:
    王成蒙, et al. "基于多源公开数据库整合分析核心基因构建肺腺癌预后风险模型" .中国肺癌杂志 28,10(2025):751-760.
  • 入库时间:
    1/26/2026 9:47:38 PM
  • 更新时间:
    3/12/2026 9:44:35 PM
浏览次数:51 下载次数:0
浏览次数:51
下载次数:0
打印次数:0
浏览器支持: Google Chrome   火狐   360浏览器极速模式(8.0+极速模式) 
返回顶部